Bdtyk

Коагуляционный фактор II (тромбин)
	; ; Человеческий тромбин в комплексе с ингибитором (гирудин).;
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB;
Список идентификаторов PDB
	; 1A2C, 1A3B, 1A3E, 1A46, 1A4W, 1A5G, 1A61, 1ABI, 1ABJ, 1AD8, 1AE8, 1AFE, 1AHT, 1AI8, 1AIX, 1AWF, 1AWH, 1AY6, 1B5G, 1B7X, 1BA8, 1BB0, 1BCU, 1BHX, 1BMM, 1BMN, 1BTH, 1C1U, 1C1V, 1C1W, 1C4U, 1C4V, 1C4Y, 1C5L, 1C5N, 1C5O, 1CA8, 1D3D, 1D3P, 1D3Q, 1D3T, 1D4P, 1D6W, 1D9I, 1DE7, 1DIT, 1DM4, 1DOJ, 1DWB, 1DWC, 1DWD, 1DWE, 1DX5, 1E0F, 1EB1, 1EOJ, 1EOL, 1FPC, 1FPH, 1G30, 1G32, 1G37, 1GHV, 1GHW, 1GHX, 1GHY, 1GJ4, 1GJ5, 1H8D, 1H8I, 1HAG, 1HAH, 1HAI, 1HAO, 1HAP, 1HBT, 1HDT, 1HGT, 1HLT, 1HUT, 1HXE, 1HXF, 1IHS, 1IHT, 1JMO, 1JOU, 1JWT, 1K21, 1K22, 1KTS, 1KTT, 1LHC, 1LHD, 1LHE, 1LHF, 1LHG, 1MH0, 1MU6, 1MU8, 1MUE, 1NM6, 1NO9, 1NRN, 1NRO, 1NRP, 1NRQ, 1NRR, 1NRS, 1NT1, 1NU7, 1NU9, 1NY2, 1NZQ, 1O0D, 1O2G, 1O5G, 1OOK, 1OYT, 1P8V, 1PPB, 1QBV, 1QHR, 1QJ1, 1QJ6, 1QJ7, 1QUR, 1RD3, 1RIW, 1SB1, 1SFQ, 1SG8, 1SGI, 1SHH, 1SL3, 1SR5, 1T4U, 1T4V, 1TA2, 1TA6, 1TB6, 1TBZ, 1THP, 1THR, 1THS, 1TMB, 1TMT, 1TMU, 1TOM, 1TQ0, 1TQ7, 1TWX, 1UMA, 1UVS, 1VR1, 1VZQ, 1W7G, 1WAY, 1WBG, 1XM1, 1XMN, 1YPE, 1YPG, 1YPJ, 1YPK, 1YPL, 1YPM, 1Z71, 1Z8I, 1Z8J, 1ZGI, 1ZGV, 1ZRB, 2A0Q, 2A2X, 2A45, 2AFQ, 2ANK, 2ANM, 2B5T, 2BDY, 2BVR, 2BVS, 2BVX, 2BXT, 2BXU, 2C8W, 2C8X, 2C8Y, 2C8Z, 2C90, 2C93, 2CF8, 2CF9, 2CN0, 2FEQ, 2FES, 2GDE, 2GP9, 2H9T, 2HGT, 2HNT, 2HPP, 2HPQ, 2HWL, 2JH0, 2JH5, 2JH6, 2OD3, 2PGB, 2PGQ, 2PKS, 2PW8, 2R2M, 2THF, 2UUF, 2UUJ, 2UUK, 2V3H, 2V3O, 2ZC9, 2ZDA, 2ZDV, 2ZF0, 2ZFF, 2ZFP, 2ZFQ, 2ZFR, 2ZG0, 2ZGB, 2ZGX, 2ZHE, 2ZHF, 2ZHQ, 2ZHW, 2ZI2, 2ZIQ, 2ZNK, 2ZO3, 3B23, 3B9F, 3BEF, 3BEI, 3BF6, 3BIU, 3BIV, 3BV9, 3C1K, 3C27, 3D49, 3DA9, 3DD2, 3DHK, 3DT0, 3DUX, 3E6P, 3EE0, 3EGK, 3EQ0, 3F68, 3GIC, 3GIS, 3HAT, 3HKJ, 3HTC, 3JZ1, 3JZ2, 3K65, 3LDX, 3LU9, 3NXP, 3P17, 3P6Z, 3P70, 3PMH, 3PO1, 3QDZ, 3QGN, 3QLP, 3QTO, 3QTV, 3QWC, 3QX5, 3R3G, 3RLW, 3RLY, 3RM0, 3RM2, 3RML, 3RMM, 3RMN, 3RMO, 3S7H, 3S7K, 3SHA, 3SHC, 3SI3, 3SI4, 3SQE, 3SQH, 3SV2, 3T5F, 3TU7, 3U69, 3U8O, 3U8R, 3U8T, 3U98, 3U9A, 3UTU, 3UWJ, 3VXE, 3VXF, 4AX9, 4AYV, 4AYY, 4AZ2, 4BAH, 4BAK, 4BAM, 4BAN, 4BAO, 4BAQ, 4BOH, 4CH2, 4CH8, 4DIH, 4DII, 4DT7, 4DY7, 4E05, 4E06, 4E7R, 4H6S, 4H6T, 4HFP, 4HFY, 4HTC, 4HZH, 4I7Y, 4LZ1, 4LZ4, 4MLF, 4N3L, 4NZE, 4NZQ, 4O03, 4THN, 5GDS, 7KME, 8KME;
Идентификаторы
Символ	; F2 ; PT; RPRGL2; THPH1
Внешние ID	; OMIM: 176930 MGI: 88380 HomoloGene: 426 ChEMBL: 204 GeneCards: F2 Gene;
номер EC	3.4.21.5
Генная онтология
Функция	; • serine-type endopeptidase activity; • receptor binding; • calcium ion binding; • protein binding; • growth factor activity; ; • thrombospondin receptor activity; ;
Компонент клетки	; • extracellular region; • extracellular space; • endoplasmic reticulum lumen; • Golgi lumen; • plasma membrane; • extracellular vesicular exosome; ; • blood microparticle; ;
Биологический процесс	; • positive regulation of protein phosphorylation; • proteolysis; • acute-phase response; • cell surface receptor signaling pathway; • multicellular organismal development; • blood coagulation; • blood coagulation, intrinsic pathway; • positive regulation of cell proliferation; • regulation of cell shape; • response to wounding; • negative regulation of platelet activation; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling; • peptidyl-glutamic acid carboxylation; • platelet activation; • regulation of blood coagulation; • positive regulation of blood coagulation; • positive regulation of cell growth; • positive regulation of collagen biosynthetic process; • fibrinolysis; • post-translational protein modification; • cellular protein metabolic process; • negative regulation of proteolysis; • negative regulation of astrocyte differentiation; • leukocyte migration; • positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol; • cytosolic calcium ion homeostasis; • negative regulation of fibrinolysis; • positive regulation of phospholipase C-activating G-protein coupled receptor signaling pathway; ; • positive regulation of reactive oxygen species metabolic process; ;
	Источники: Amigo / QuickGO;
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи
	; Шаблон: просмотр • обсуждение • править;

Тромбин (фактор свёртывания II) — сериновая протеаза, важнейший компонент системы свёртывания крови человека и животных. Тромбин относится к ферментам класса гидролаз (КФ 3.4.21.5). Катализирует гидролиз пептидных связей, образованных остатками аргинина и лизина, обладает ограниченной субстратной специфичностью.

Содержание

1 Синтез

2 Регуляция воспаления

3 См.также

4 Примечания

Синтез |

Тромбин образуется при ферментативном отщеплении двух участков от протромбина активированным фактором X (Xa). Активность фактора Xa существенно повышается при его связывании с активированным фактором V (Va), что приводит к образованию т.н. протромбиназного комплекса. Протромбин синтезируется в печени и подвергается ко-трансляционной модификации в ходе витамин K-зависимой реакции, приводящей к конвертации 10 остатков глутаминовой кислоты (Glu) в гамма-карбоксиглутаминовую кислоту (Gla). В присутствии кальция остатки гамма-карбоксиглутаминовой кислоты обеспечивают связывание протромбина с фосфолипидным бислоем мембраны. Недостаточность витамина K или присутствие антикоагулянта варфарина ингибирует образование гамма-карбоксиглутаминовой кислоты, что замедляет процесс свёртывания крови.

Уровень тромбина в крови постепенно повышается с момента рождения пока не достигнет нормального уровня взрослого человека: с концентрации 0,5 U/мл через 1 день после рождения до 0,9 U/мл в 6-месячном возрасте^[2].

Регуляция воспаления |

Тромбин, помимо гемостаза, участвует в регуляции процессов воспаления. Его действие реализуется через рецепторы, активируемые протеазами и зависит от концентрации^[3].

См.также |

Свёртывание крови

Тромбомодулин

Примечания |

↑ PDB 2C93; Howard N, Abell C, Blakemore W, Chessari G, Congreve M, Howard S, Jhoti H, Murray CW, Seavers LC, van Montfort RL (February 2006). “Application of fragment screening and fragment linking to the discovery of novel thrombin inhibitors”. J. Med. Chem. 49 (4): 1346—55. DOI:10.1021/jm050850v. PMID 16480269..mw-parser-output cite.citation{font-style:inherit}.mw-parser-output q{quotes:"""""""'""'"}.mw-parser-output code.cs1-code{color:inherit;background:inherit;border:inherit;padding:inherit}.mw-parser-output .cs1-lock-free a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/65/Lock-green.svg/9px-Lock-green.svg.png")no-repeat;background-position:right .1em center}.mw-parser-output .cs1-lock-limited a,.mw-parser-output .cs1-lock-registration a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d6/Lock-gray-alt-2.svg/9px-Lock-gray-alt-2.svg.png")no-repeat;background-position:right .1em center}.mw-parser-output .cs1-lock-subscription a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/aa/Lock-red-alt-2.svg/9px-Lock-red-alt-2.svg.png")no-repeat;background-position:right .1em center}.mw-parser-output .cs1-subscription,.mw-parser-output .cs1-registration{color:#555}.mw-parser-output .cs1-subscription span,.mw-parser-output .cs1-registration span{border-bottom:1px dotted;cursor:help}.mw-parser-output .cs1-hidden-error{display:none;font-size:100%}.mw-parser-output .cs1-visible-error{font-size:100%}.mw-parser-output .cs1-subscription,.mw-parser-output .cs1-registration,.mw-parser-output .cs1-format{font-size:95%}.mw-parser-output .cs1-kern-left,.mw-parser-output .cs1-kern-wl-left{padding-left:0.2em}.mw-parser-output .cs1-kern-right,.mw-parser-output .cs1-kern-wl-right{padding-right:0.2em}

↑ Andrew M, Paes B, et al. (1987). “Development of the human coagulation system in the full-term infant”. Blood. 70 (1): 165—172. PMID 3593964.

↑ Strukova S.M. (2001). “Thrombin as a regulator of inflammation and reparative processes in tissues”. Biochemistry (Moscow). 66 (1): 8–18. DOI:10.1023/A:1002869310180. ISSN 0006-2979. (англ.)

[pmid16480269-1] PDB 2C93; Howard N, Abell C, Blakemore W, Chessari G, Congreve M, Howard S, Jhoti H, Murray CW, Seavers LC, van Montfort RL (February 2006). “Application of fragment screening and fragment linking to the discovery of novel thrombin inhibitors”. J. Med. Chem. 49 (4): 1346—55. DOI:10.1021/jm050850v. PMID 16480269..mw-parser-output cite.citation{font-style:inherit}.mw-parser-output q{quotes:"""""""'""'"}.mw-parser-output code.cs1-code{color:inherit;background:inherit;border:inherit;padding:inherit}.mw-parser-output .cs1-lock-free a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/65/Lock-green.svg/9px-Lock-green.svg.png")no-repeat;background-position:right .1em center}.mw-parser-output .cs1-lock-limited a,.mw-parser-output .cs1-lock-registration a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d6/Lock-gray-alt-2.svg/9px-Lock-gray-alt-2.svg.png")no-repeat;background-position:right .1em center}.mw-parser-output .cs1-lock-subscription a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/aa/Lock-red-alt-2.svg/9px-Lock-red-alt-2.svg.png")no-repeat;background-position:right .1em center}.mw-parser-output .cs1-subscription,.mw-parser-output .cs1-registration{color:#555}.mw-parser-output .cs1-subscription span,.mw-parser-output .cs1-registration span{border-bottom:1px dotted;cursor:help}.mw-parser-output .cs1-hidden-error{display:none;font-size:100%}.mw-parser-output .cs1-visible-error{font-size:100%}.mw-parser-output .cs1-subscription,.mw-parser-output .cs1-registration,.mw-parser-output .cs1-format{font-size:95%}.mw-parser-output .cs1-kern-left,.mw-parser-output .cs1-kern-wl-left{padding-left:0.2em}.mw-parser-output .cs1-kern-right,.mw-parser-output .cs1-kern-wl-right{padding-right:0.2em}

[2] Andrew M, Paes B, et al. (1987). “Development of the human coagulation system in the full-term infant”. Blood. 70 (1): 165—172. PMID 3593964.

[3] Strukova S.M. (2001). “Thrombin as a regulator of inflammation and reparative processes in tissues”. Biochemistry (Moscow). 66 (1): 8–18. DOI:10.1023/A:1002869310180. ISSN 0006-2979. (англ.)

Эндопептидазы: сериновые протеазы/сериновые эндопептидазы (КФ 3.4.21)
Ферменты пищеварения	Энтеропептидаза Трипсин Химотрипсин Эластаза (Нейтрофильная, Панкреатическая)
Коагуляция	факторы: Тромбин Фактор VIIa Фактор IXa Фактор Xa Фактор XIa Фактор XIIa Калликреин (PSA) фибринолиз: Плазмин Активатор плазминогена (Тканевой, Урокиназный)
Система комплемента	Фактор B Фактор D Фактор I MASP (MASP1, MASP2) C3-конвертаза
Другие, иммунная система:	Химаза Гранзим Триптаза Протеиназа 3/Миелобластин
Из биотоксинов:	Анкрод Батроксобин
Другие	Акрозин Пролилэндопептидаза Проназа Пропротеинконвертаза (1, 2) Рилин Субтилизин/Фурин Стрептокиназа S1P Катепсин (A, G) ClpP Lon

搜尋此網誌

Bdtyk

Тромбин

Содержание

Синтез |

Регуляция воспаления |

См.также |

Примечания |

Popular posts from this blog

Meaning of 'jiggelin' - word from the song 'Policeman' of Eva Simons

Высокополье (Харьковская область)

Усть-Каменогорск